实验室致力于应用基因组学、统计遗传学和系统生物学的方法整合分析并挖掘高通量、多维度的组学数据，同时结合分子生物学实验，探索复杂疾病（包括精神类疾病、自身免疫性疾病）的分子遗传机制及致病机理，为复杂疾病的早期诊断、疾病干预方案的制定以及药物靶点的寻找提供科学依据。

主要研究内容包括：

一、 复杂疾病的候选基因研究

为研究复杂疾病的遗传机制，实验室在疾病遗传学数据库的构建、候选基因优先级排序、候选基因筛选、目标测序区域筛选等方面建立了相关的技术方法与策略。同时，基于收集筛选的数据，将在精神类疾病、自身免疫性疾病中展开具体的候选基因关联研究、目标区域测序研究及全基因组关联研究。最后，对得到的可靠位点和基因，结合分子生物学实验分析其功能。

二、 复杂疾病的多维度组学数据的通路网络分析

复杂疾病的多层次研究已经积累大量的、多维度的组学数据，包括遗传学数据、表达数据、各种网络数据等。为深入研究复杂疾病的致病机制，实验室建立了多种组学数据的通路网络分析算法与工具，包括寻找疾病相关通路的基于通路的分析、疾病相关网络模块的分析以及遗传学数据和表达数据整合分析的算法。在此基础上，我们在多个精神类疾病中，包括精神分裂症、双相情感障碍中展开了疾病相关通路与网络模块研究。

三、 复杂疾病的遗传环境交互作用研究

复杂疾病除受遗传因素影响外，还会受非遗传的环境因素影响。环境因素与遗传因素间的复杂交互作用是疾病异质性的重要因素之一。实验室从环境因素相关的基因表达数据入手探讨基因-环境交互作用。我们通过对公共数据的深入挖掘，构建受特定环境因素影响的基因调控及功能网络，并对该网络进行系统生物学分析，进而对网络中的核心环节进行分子生物学实验探索。